劳动力与维护成本居高不下
污水处理设备在运行过程中对技术人员的要求较高，尤其是自动化程度不足的传统设备，需要配备经过专业培训的运营人员进行实时监控和调整。根据行业调研数据，某中型污水处理厂的年人员配备成本约占总运营预算的15%—20%，而维修保养费用则占到另外10%—15%。此外，部分设备在运行初期由于磨合不佳，还会出现频繁报修的情况，进一步增加了运维负担。
处理效率受到环境与污染物类型限制
目前市场上普遍使用的活性污泥法等处理工艺，对进水水质的稳定性要求较高，一旦遭遇污染物浓度剧烈波动或异常成分（如化学试剂残留、重金属等），处理效率会显著下降。例如，在处理含有高浓度石油烃的工业废水时，传统设备的去除率可能仅达到30%—50%，远低于对常规有机污染物的80%以上去除率。
能耗较高，运行成本压力大
污水处理过程中，对水泵、曝气机和搅拌机等设备的能耗尤其突出，单台曝气机的功率通常在15—75千瓦，年运行成本可达数万元人民币。据统计，整个污水处理流程中，曝气系统的能耗占总能耗的50%—60%，这使得设备运行成本居高不下，尤其是在电价上涨的背景下，企业面临更大的财务压力。
设备老化与更换周期短
部分低品质污水处理设备在使用2—3年后容易出现腐蚀、密封失效或零部件损坏等问题，缩短了使用寿命并增加了更换成本。同时，由于技术更新迭代速度较快，旧设备难以兼容新工艺标准，导致企业不得不进行提前更换，资产回报率下降。
环境与监管风险并存
污水处理设备在运行过程中可能因处理不彻底而排放超标废水，面临政府环保部门的处罚风险，罚款金额通常在1万—50万元不等。同时，设备产生的污泥等副产物 disposal 不当也可能引发次生污染问题，增加企业的法律与声誉成本。
处理效果不稳定，难以满足严苛标准
随着环保标准的不断提高（例如我国发布的《城镇污水处理厂污染物排放标准》GB 3190—2019），部分老旧设备已难以满足最新的去除率要求，尤其是在处理氨氮、总氮等指标时，达标率可能低于90%，影响企业的合规性。